Concevoir et réaliser des développements bioinformatiques et de biostatistiques: Assemblage de novo d'un génome de champignon (35Mb) à partir de données Illumina et PacBio/Nanopore; Annotation du génome grâce à des données de RNA-seq chez le sauvage; Analyse de données RNA-seq chez des mutants; Définir, mettre en œuvre et mettre à jour un Plan de Gestion de Données (PGD); Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, présentations orales; Assurer et organiser la veille scientifique et technologique
Requirements:
Formation en bioinformatique; Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ADN; Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ARN; Expérience en biostatistiques; Gestion de workflow; Rigueur et autonomie; Connaissances des règles FAIR de reproductibilité; Connaissances en génomiques et génétiques (transcription, recombinaison); Langue anglaise: Niveau A1; Sens des responsabilités; Bonne capacité de communication, notamment avec des non bioinformaticiens; Excellentes qualités relationnelles
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En poursuivant votre navigation sur ce site, vous acceptez le dépôt de cookies dans votre navigateur. ( En savoir plus ) CNRS - Portail emploi recrutement Centre National de la Recherche Scientifique CNRS Les annuaires de l'organisme Mots-clefs CNRS Travailler au CNRS CNRS en région Français English Portail Emploi Accueil Présentation Toutes les offres Recherche simple Recherche avancée Bassins d'emploi Aide Aide à l'utilisation du site Nous contacter Nous suivre Flux RSS des offres Notre page Facebook Notre compte Twitter Portail > Offres > Offre UMR9198-CHLGIR-009 - Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F) - Génomique Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F) - Génomique Date Limite Candidature : mercredi 8 mai 2024 Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F) - Génomique Référence : UMR9198-CHLGIR-009 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE Date de publication : mercredi 17 avril 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 10 mois Date d'embauche prévue : 1 juin 2024 Quotité de travail : Temps complet Rémunération : Salaire brut mensuel entre 2 866€ à 3 029€ selon expérience Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac 5 et plus) Expérience souhaitée : Indifférent BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données Missions L’ingénieur en bioinformatique aura pour mission de mener un projet d’analyse de données génomiques (ADN et ARN) dans le cadre d’un projet sur la régulation de la formation des crossovers méiotiques chez le champignon filamenteux Sordaria macrospora. Activités Concevoir et réaliser des développements bioinformatiques et de biostatistiques : - Assemblage de novo d'un génome de champignon (35Mb) à partir de données Illumina et PacBio/Nanopore - Annotation du génome grâce à des données de RNA-seq chez le sauvage - Analyse de données RNA-seq chez des mutants - Définir, mettre en œuvre et mettre à jour un Plan de Gestion de Données (PGD) - Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, présentations orales - Assurer et organiser la veille scientifique et technologique Compétences - Formation en bioinformatique - Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ADN - Expérience de programmation pour l’analyse de données de séquençage ARN - Expérience en biostatistiques - Gestion de workflow - Rigueur et autonomie - Connaissances des règles FAIR de reproductibilité - Connaissances en génomiques et génétiques (transcription, recombinaison) - Langue anglaise : Niveau A1 - Sens des responsabilités - Bonne capacité de communication, notamment avec des non bioinformaticiens - Excellentes qualités relationnelles. Contexte de travail L'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) est une très grande unité mixte de recherche CNRS, CEA et Université Paris Saclay, situé sur le campus de recherche de Gif-sur-Yvette. Avec un effectif moyen de près de 650 personnes réparties entre 5 départements scientifiques, l'I2BC rassemble 60 équipes de recherche travaillant sur tous les aspects de la cellule, des constituants cellulaires jusqu'à l'interaction des cellules entre elles. Le département Biologie des Génomes se focalise sur l'étude du matériel génétique. L’Équipe Appariement et Recombinaison Méiotique s'intéresse aux mécanismes moléculaires de la méiose, une étape clé de la reproduction sexuée. L’équipe est composée de 3 chercheurs et d’une ingénieure de recherche permanents, 2 étudiants en thèse, une post-doctorante et 2 ingénieurs en CDD. Le projet, coordonné par deux chercheurs permanents, porte sur la caractérisation de différents acteurs régulant la formation des crossovers méiotiques, échanges réciproques d’ADN entre chromosomes homo- logues qui ont lieu pendant la méiose. Nous utilisons pour ce faire deux organismes modèles : la plante Arabidopsis thaliana et le champignon filamenteux Sordaria macrospora. Possibilité de restauration CNRS remboursement partiel des frais de transport en commun. Contraintes et risques Pas d’astreinte d’horaires. Logo Republique Française et CNRS Aide Plan du site Nous contacter Mentions Légales CGU Donnees Personnelles Cookies Français English Logo HRS4R
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