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Position: Postdoctoral researcher (m/f/d) in bioinformatics
Institution: Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Location: Freiburg im Breisgau, Baden‐Württemberg, Germany
Duties: The postdoctoral researcher will redesign, upgrade and expand this database by for example analyzing and integrating data from phosphoproteomics studies and including predictive analyses. A major aim is to identify involved substrates and pathways of the activator treatment, for which the group applies phosphoproteomics combined with new technologies
Requirements: Qualified candidates will have (or be about to obtain) a Ph.D. degree; Documented experience in bioinformatics such as: web and database development with HTML, JavaScript, PHP and MySQL/PostgreSQL, or using React libraries and MongoDB, and coding in one or more scripting languages in a LINUX/UNIX-based context; Ideally, familiarity with popular bioinformatics databases including protein, gene and protein-protein interaction databases, with protein-protein interaction networks analysis using tools like Cytoscape
   
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Fulltime position Kennziffer: 00002646 Beschreibung The University of Freiburg is, with more than 25.000 students and over 5.000 employees in 11 faculties, one of Germany’s leading research institutions. The Department for Integrative Signaling Research of Prof. Dr. Maja Köhn at the Institute of Biology III is a member of the Excellence Centers CIBSS and BIOSS, which focus on biological signalling research. The research focus of the department is the investigation of phosphatases and the development of chemical tools for their investigation (J. Cell Sci. 2022, ACS Cent. Sci. 2020, ACS Chem. Biol. 2016). For this purpose, the group combines methods of synthetic chemistry, biochemistry, molecular and cell biology, as well as bioinformatics. Job description Phosphatases are crucial enzymes in health and disease, but the knowledge of their biological roles is still limited. To support the research on phosphatases, the group of Prof. Köhn developed the human dephosphorylation database, DEPOD (www.depod.org), which is a public database on human phosphatases and their substrates (Sci. Signal. 2013, Nucleic Acids Res. 2015, Database 2019). The postdoctoral researcher will redesign, upgrade and expand this database by for example analyzing and integrating data from phosphoproteomics studies and including predictive analyses. Furthermore, this position is funded by the Consolidator grant of the European Research Council “PDPcardio” awarded to Prof. Köhn. Within this project, the group studies the effects of activation of protein phosphatase-1 (PP1) in heart failure. The group developed PP1 activating compounds and showed therapeutic effects in the heart (Angew. Chem. 2012, Eur. J. Heart Fail. 2018). A major aim is to identify involved substrates and pathways of the activator treatment, for which the group applies phosphoproteomics combined with new technologies (Nat. Commun. 2020). The large data sets resulting from these studies will be analyzed by the postdoctoral researcher and incorporated into DEPOD. Required qualifications and experience Qualified candidates will have (or be about to obtain) a Ph.D. degree. Documented experience in bioinformatics such as: web and database development with HTML, JavaScript, PHP and MySQL/PostgreSQL, or using React libraries and MongoDB, and coding in one or more scripting languages in a LINUX/UNIX-based context. Ideally, familiarity with popular bioinformatics databases including protein, gene and protein-protein interaction databases, with protein-protein interaction networks analysis using tools like Cytoscape. Prior experience with (phospho)proteomics analysis, data mining, protein structure modeling, molecular docking and molecular dynamics (MD) simulation is a further advantage. The ability to work in a team, very good communication skills in English and self-motivation. The position is full-time (100%) and initially limited to two years. Appointments on fixed term contracts can be renewed, depending on circumstances at the time of the review. The remuneration is based on German E13 TV-L. Please include in your application a motivation letter and CV including publications. We are particularly pleased to receive applications from women for the position advertised here. Bewerbung Please send your application including supporting documents mentioned above citing the reference number 00002646, by 18.12.2022 at the latest. Please send your application to the following address in written or electronic form: Albert-Ludwigs-University Freiburg BIOSS Centre for Biological Signalling Studies Prof. Maja Banks-Köhn Signalhaus 79104 Freiburg Email: maja.koehn@bioss.uni-freiburg.de For further information, please contact Dr. Maja Banks-Koehn on the phone number 49 761 203-67900 or E-Mail maja.koehn@bioss.uni-freiburg.de . General and legal remarks Full-time positions may generally be split up into two or more part-time positions, provided that there are no formal or legal barriers. Candidates are selected in accordance with the provisions of the AGG (Allgemeines Gleichbehandlungsgesetz - German General Equal Treatment Act). Applicants with disabilities (Schwerbehinderte Menschen) will be given preferential consideration in case of equal qualification. The department offering the position is liable for the content of this job posting. Textual errors do not constitute a basis for any claims or rights. The relevant human resources department has sole responsibility for all legal transactions made within the context of the selection and hiring process. Please note that breaches in privacy and unauthorized access by third parties cannot be excluded in communication by unencrypted email. Privatsphäre Privacy Policy Scientific Employment Jetzt bewerben Arbeiten an der Universität Freiburg Die Universität Freiburg ist einen Wechsel wert: Mit ihrer über 500-jährigen Geschichte ist sie eine der renommiertesten und forschungsstärksten Universitäten Deutschlands. Hier arbeiten Sie in einer einzigartigen Vielfalt von Fächern, Perspektiven und Menschen für Forschung und Lehre auf höchstem Niveau - mitten in einer der beliebtesten Städte Deutschlands … Die Personalpolitik der Albert-Ludwigs-Universität Freiburg orientiert sich an den Prinzipien der Gleichstellung und Vielfalt. Die Universität bekennt sich nachdrücklich zu dem Ziel einer familiengerechten Hochschule. MEHR Quelle: postdoctoral researcher (m/f/d) in bioinformatics https://uni-freiburg.de/universitaet/jobs/ (21.11.2022) Mediennachweis Peter Mesenholl Kontakt Stellenangebote Einrichtungen Karten Logins Hilfe im Notfall Impressum Datenschutzerklärung Barrierefreiheit Facebook Twitter Instagram YouTube Xing LinkedIn Mastodon Academic Consortium 21 Eucor - The european campus German U15 LERU - League of European Research Universities Diversity an der Uni Freiburg Gleichstellung an der Uni Freiburg © 2022 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg. Besuchsadresse: Friedrichstr. 39, 79098 Freiburg | Postadresse: Postfach, 79085 Freiburg
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