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Position: Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) Bioinformatik
Institution: Charité - Universitätsmedizin Berlin
Location: Berlin, Germany
Duties: Etablierung eines bioinformatischen Workflows für die cluster-basierte Analyse viraler Genomsequenzen; Entwicklung neuer und Anwendung bestehender Algorithmen und Pipelines zur Analyse von Metagenomik-Daten; Pathogen- und Quasispezies-Identifikation und Beschreibung; Auswertung und Erstellung von Skripten zur Analyse komplexer transkriptomischer Datensätze; Statistische Auswertung, Generalized Linear Models, Hauptkomponentenanalyse; phylogenetische Analysen
Requirements: Hochschulabschluss in Bioinformatik/Informatik/Statistik oder verwandten Bereichen; Erfahrung in der Arbeit mit High-Throughput-Sequenzierungsdatenanalysen; Erfahrung in der Arbeit mit Unix/Linux-Umgebungen; Gute Kenntnisse in verschiedenen Programmiersprachen (z.B. Python, R, Perl, Java, C++); Erfahrung mit Workflow-Management-Systemen (Snakemake, Nextflow)
   
Text: Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) Bioinformatik Etablierung eines bioinformatischen Workflows für die cluster-basierte Analyse viraler Genomsequenzen; Entwicklung neuer und Anwendung bestehender Algorithmen und Pipelines zur Analyse von Metagenomik-Daten; Pathogen- und Quasispezies-Identifikation und Beschreibung; Auswertung und Erstellung von Skripten zur Analyse komplexer transkriptomischer Datensätze; Statistische Auswertung, Generalized Linear Models, Hauptkomponentenanalyse; phylogenetische Analysen Hochschulabschluss in Bioinformatik/Informatik/Statistik oder verwandten Bereichen; Erfahrung in der Arbeit mit High-Throughput-Sequenzierungsdatenanalysen; Erfahrung in der Arbeit mit Unix/Linux-Umgebungen; Gute Kenntnisse in verschiedenen Programmiersprachen (z.B. Python, R, Perl, Java, C++); Erfahrung mit Workflow-Management-Systemen (Snakemake, Nextflow)
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