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Position: Research Position: Computational protocols for the rapid screening of nanoparticle/analyte interaction and for the computational nanoreceptors design
Institution: Università degli Studi di Padova
Location: Padova, Italy
Duties: The goal of the research project will be to develop computational protocols for the rapid screening of the nanoparticle/analyte interaction and for the computational design of nanoreceptors. These protocols will be validated by studying a large number of pairs of analyte-nanoparticles (at least 100) and comparing the rankings obtained with experimentally determined affinities. The best performing nanoparticles, once identified, will be analyzed in detail with prolonged MD simulations to allow the precise characterization of the monolayer structure and its interaction with the analyte. Eventually, other analytes will be screened with the best performing nanoparticles to evaluate potential interferents. The activity will take place at the IIT in Genoa, with which a special agreement has been signed, under the scientific supervision of prof M De Vivo
Requirements: Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate)
   
Text: Bando per assegno di ricerca Descrizione del bando Titolo del progetto di ricerca in italiano Protocolli computazionali per lo screening rapido dell'interazione nanoparticelle / analiti e per la progettazione di nanorecettori computazionali Titolo del progetto di ricerca in inglese Computational protocols for the rapid screening of nanoparticle/analyte interaction and for the computational nanoreceptors design Area CUN 03 - Scienze chimiche S.S.D - Descrizione sintetica in italiano L'obiettivo del progetto di ricerca sarà quello di mettere a punto protocolli computazionali per lo screening rapido dell'interazione nanoparticelle/analiti e per la progettazione computazionale di nanorecettori. Questi protocolli verranno validati studiando un gran numero di coppie di analita-nanoparticelle (almeno 100) e confrontando le classifiche ottenute con affinità determinate sperimentalmente. Le nanoparticelle più performanti, una volta identificate, verranno analizzate in dettaglio con simulazioni MD prolungate per consentire la caratterizzazione precisa della struttura monostrato e la sua interazione con l'analita. Alla fine, verranno valutati ulteriori analiti capaci di interagire con le nanoparticelle con le migliori prestazioni per valutare potenziali interferenti. L’attività si svolgerà presso l’IIT di Genova, con cui è stata stipulata apposita convenzione, sotto la supervisione scientifica del prof. M De Vivo. Descrizione sintetica in inglese The goal of the research project will be to develop computational protocols for the rapid screening of the nanoparticle/analyte interaction and for the computational design of nanoreceptors. These protocols will be validated by studying a large number of pairs of analyte-nanoparticles (at least 100) and comparing the rankings obtained with experimentally determined affinities. The best performing nanoparticles, once identified, will be analyzed in detail with prolonged MD simulations to allow the precise characterization of the monolayer structure and its interaction with the analyte. Eventually, other analytes will be screened with the best performing nanoparticles to evaluate potential interferents. The activity will take place at the IIT in Genoa, with which a special agreement has been signed, under the scientific supervision of prof M De Vivo. Data del bando 17/02/2021 Paesi in cui può essere condotta la ricerca Italy Paesi di residenza dei candidati OTHER Nazionalità dei candidati OTHER Sito web del bando http://www.unipd.it Dettagli dell'assegno di ricerca Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) Finanziatore Nome dell'Ente finanziatore Università degli Studi di Padova Tipologia dell'Ente Public research Paese dell'Ente Italy Città Padova Sito web http://www.unipd.it Contatto presso l'Ente E-mail scientifica.chimica@unipd.it EU Research Framework Programme L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? No Dettagli per la candidatura Data di scadenza del bando 04/03/2021 Come candidarsi Other
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