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Position: Research Position: Protein phase separation into disordered condensates: a statistical mechanics approach”
Institution: Università degli Studi di Padova
Location: Padova, Italy
Duties: Protein liquid-liquid phase separation (LLPS) allows bio-molecules in living cells to form dense liquid condensates without diffusing away. The aim of this project is to predict the LLPS behaviour of proteins, based on theoretical tools and on the knowledge of the aminoacid sequence alone. The post-doc will pursue a multiscale approach developing different tools: knowledge-based potentials to model the specific short-range interactions involved in LLPS; generalized mean field Flory-Huggins theories that include sequence specificity; reaction-diffusion models
Requirements: Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate); Prior knowledge of theoretical and numerical methods in statistical biophysics is recommended
   
Text: Bando per assegno di ricerca Descrizione del bando Titolo del progetto di ricerca in italiano Separazione di fase di proteine in condensati disordinati: un approccio meccanico-statistico Titolo del progetto di ricerca in inglese Protein phase separation into disordered condensates: a statistical mechanics approach” Area CUN 02 - Scienze fisiche S.S.D FIS/03 - FISICA DELLA MATERIA Descrizione sintetica in italiano La separazione di fase liquido-liquido di proteine (LLPS) permette alle biomolecole di formare densi condensati liquidi evitandone la diffusione nell’ambiente cellulare. Lo scopo di questo progetto e’ predire il comportamento LLPS delle proteine basandosi sulla conoscenza della sequenza aminoacidica. L’assegnista sviluppera’ un approccio multiscala utilizzando: potenziali empirici per descrivere le specifiche interazioni a corto raggio cruciali per LLPS; teorie di campo medio alla Flory-Huggins che tengano conto della specificita’ di sequenza; modelli di reazione-diffusione. I predittori cosi’ sviluppati verranno testati su dati sperimentali e implementati in a web server in collaborazione con il gruppo del Prof. S. Tosatto al Dipartimento di Scienze Biomediche di UNIPD. Si richiede la conoscenza di metodi teorici e numerici in biofisica statistica. Descrizione sintetica in inglese Protein liquid-liquid phase separation (LLPS) allows bio-molecules in living cells to form dense liquid condensates without diffusing away. The aim of this project is to predict the LLPS behaviour of proteins, based on theoretical tools and on the knowledge of the aminoacid sequence alone. The post-doc will pursue a multiscale approach developing different tools: knowledge-based potentials to model the specific short-range interactions involved in LLPS; generalized mean field Flory-Huggins theories that include sequence specificity; reaction-diffusion models. The developed predictors will be benchmarked against available experimental data and implemented in a web server, in collaboration with Prof. S. Tosatto and his group at the Department of Biomedical Sciences at UNIPD. Prior knowledge of theoretical and numerical methods in statistical biophysics is recommended. Data del bando 07/06/2019 Numero di assegnazioni per anno 1 Paesi in cui può essere condotta la ricerca Italy Paesi di residenza dei candidati International Nazionalità dei candidati International Sito web del bando https://protocollo.unipd.it/albo/viewer Dettagli dell'assegno di ricerca Destinatari dell'assegno di ricerca (of target group) Early stage researcher or 0-4 yrs (Post graduate) Il contratto prevede la copertura delle prestazioni sociali? yes Importo annuale 19.810 Valuta Euro Comprende lo stipendio dell'assegnista yes Massima durata dell'assegno (mesi) 24 Criteri di selezione in italiano (breve descrizione) La selezione si attua mediante la valutazione comparativa dei titoli, del curriculum scientifico-professionale, della produttività scientifica e di un colloquio Criteri di selezione in inglese (breve descrizione) The selection takes place through the evaluation of the titles, scientific and professional CV, academic/scientific publications and an interview Processo di selezione in italiano (breve descrizione) Le domande dei candidati saranno esaminate da una Commissione giudicatrice nominata dal Direttore della struttura e composta da tre membri esperti del settore in cui sarà svolta l'attività di collaborazione, uno dei quali di norma è il Responsabile del Progetto di ricerca Processo di selezione in inglese (breve descrizione) The applications will be valued by a referee committee, designed by the Director of the structure and composed by three members belonging to the scientific area of the research project, one of them is normally the scientific responsible of the scientific project Finanziatore Nome dell'Ente finanziatore Università degli Studi di Padova - Dipartimento di Fisica e Astronomia Tipologia dell'Ente Public research Paese dell'Ente Italy Città Padova Codice postale 35131 Indirizzo via F. Marzolo n. 8 Sito web http://www.dfa.unipd.it/index.php?id=973 Contatto presso l'Ente E-mail segredip@pd.infn.it Telefono 39 049 8277115 EU Research Framework Programme L'assegno finanziato/cofinanziato attraverso un EU Research Framework Programme? No Dettagli per la candidatura Data di scadenza del bando 08/07/2019 Come candidarsi Other
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